
自2022年4月起,營業時間分成一般期間及繁忙期間兩種。
| 一般期間 | 8:30~18:30 ※最後入館 17:30 |
|---|---|
| 繁忙期間① | 8:30~20:00 ※最後入館 19:00 ※2026年4月25日~2026年5月6日 ※2026年7月18日~2026年7月31日 |
| 繁忙期間② | 8:30~21:00 ※最後入館 20:00 ※2026年8月1日~2026年8月31日 |
| 休園日 | 至2027年3月31日、沖繩美麗海水族館沒有休園日。 |


在水族館的週邊也設有海豚、海龜及海牛等參觀設施。
| 一般期間 | 8:30~17:30 |
|---|---|
| 繁忙期間 | 8:30~19:00 ※2026年4月25日~2026年5月6日 ※2026年7月18日~2026年8月31日 |

是可以與沖繩美麗海水族館一同使用的免費休息設施。同時在室內設有神祕的沖繩之海信息展示區。
| 一般期間 | 8:30~18:30 |
|---|---|
| 繁忙期間 | 8:30~20:00 ※2026年4月25日~2026年5月6日 ※2026年7月18日~2026年7月31日 8:30~21:00 ※2026年8月1日~2026年8月31日 ※商店「Blue Manta」的營業時間目前正在調整中。 |