在沖縄的水边展示区，展示了栖息于溪流上游流域的“环带黄瓜鰕虎（Sicyopus zosterophorus）”，以及栖息于下游流域的稀有物种“金黄叉舌鰕虎（Glossogobius aureus）”等鱼类。此外，这个展区也展示了濒临绝种的“琉球山龟（Geoemyda japonica）”，该物种被日本环境省列为国内稀有野生动植物，并被指定为国家天然纪念物。还有被列为国内稀有野生动植物和冲绳县天然纪念物的“黑岩氏瞼虎（Goniurosaurus kuroiwae）”，以及在冲绳县红色名录中濒临绝种、被指定为日本灭绝危险ⅠA类（CR＋EN）的蜗牛物种，如仅分布在北大东岛的“Nesiohelix omphalina bipyramidalis”、仅分布在南大东岛的“Nesiohelix omphalina omphalina”和仅分布在冲绳岛南部的“Satsuma amanoi”等陆生贝类。

2024年1月时的水槽情报